1937年的深秋时节，中国医生成贤（秦汉饰）携带着怀孕的日本妻子理惠子（早乙女爱饰）和他们的孩子从上海逃往南京老家，希望能避开即将到来的战争浩劫。然而，他很快发现即使是南京也几乎被侵华日军摧毁殆尽。面对可以进入欧美列强势力保护的安全区避难的机会，成贤认为自己与普通难民身份不同而没有接受这一提议，而是选择了投靠老朋友继续行医。以小学教师刘天琴（刘若英饰）为代表的同胞们遭受的悲剧深深震撼了他，使他对当时社会的现状感到愤怒。然而，在救死扶伤的过程中，成贤仍认为自己首要任务是尽职做好一名医生，而不是卷入激烈的抵抗行动。随着12月13日南京的全面沦陷，日军开始在南京疯狂地进行烧杀淫掠，成贤最终意识到日本军队的残酷和无情。他决定让妻子理惠子先行进入安全区躲避危险，而自己则选择留下来继续为那些饱受苦难的人们提供医疗援助。尽管他知道安全区早已名存实亡，并且反抗日军的时机已经错过，但成贤仍然尽己所能地坚持下去，用他的医术和善良的心灵去挽救每一个生命。这个故事不仅展现了一个医生在极端环境下坚守职责的决心，也揭示了战争中无辜民众所承受的巨大痛苦与苦难。
