在2004年的科幻灾难电影《哥斯拉终极战役》中，故事背景设定在一个被怪兽威胁的人类世界。数年前，人类通过超级战舰“轰天号”成功击退了巨兽哥吉拉，并将其封印于南极之下。然而，地球上的危险远不止此，各种怪兽开始对各个城市虎视眈眈。为了应对这一危机，人类建立了一个名为“地球防卫部”的组织来抵御怪兽的侵袭。“轰天号”及其舰长道格拉斯·戈登上校是保卫地球的关键力量之一。“超人类”——拥有特殊能力的人类——也被纳入地球防卫部中，他们拥有比普通人更为强大的体能和敏捷性。其中，尾崎真一少尉便是这些精英中的佼佼者。不久之后，人们挖掘出一个巨大的外星生物遗骸，这引发了对可能来自外太空的巨型怪兽“盖刚”的怀疑。当地球防卫部收到婴儿岛上的小美人发出的警告时，得知盖刚即将复活的消息。很快，世界各地遭遇了不同怪兽的同时袭击。正当防卫军忙于应对这些攻击之时，一个神秘飞行器突然出现，其上乘坐着自称是人类朋友、名为“X星人”的外星生物。尽管初期与X星人的合作看似顺利，但不久后，地球防卫部的调查揭露了事实：这些外星生物其实是企图利用人类作为食物来源。更糟糕的是，它们还控制着一些巨大的怪兽来摧毁地球。在一番激战之后，“轰天号”及其指挥官道格拉斯意识到解开哥吉拉封印的必要性，以期用最强大的力量来对抗即将到来的威胁——外星生物与它所带来的灾难。
