明朝初年，江南运河边的兰溪县里住着一位英俊少年徐继祖。自幼聪颖的他，虽与父亲同属一姓，却对父亲的行径嗤之以鼻，不愿认其为父。父亲徐能常年在运河上打家劫舍，直到二叔重病，二人求医无果后，才决定拜托慧波庵里的悲慈师傅诵经祈福，奇迹般地让二叔转危为安。继祖于是告别家乡亲友，前往京城参加殿试。然而，父亲徐能在二弟的劝说下终于洗心革面，决定弃恶从善，在运河边开起了修理铺，靠行善施惠赢得乡邻的好感。但过去所犯下的罪孽并未因此而消失，悲慈师傅在一次偶然的机会中认出了徐能，并向兰溪县衙报了案。与此同时，李捕快通过贿赂将三个兄弟从牢笼中解救出来。面对证据不足的情况，悲慈师傅再次找到县衙鸣冤，不巧的是，此番刷卷御史竟是继祖的旧日恩师高大人。得知真相的继祖陷入了两难境地：一边是含冤二十年的母亲，另一边则是有养育之恩却犯下滔天罪孽的父亲。在一番挣扎后，继祖决定携母前往京城，希望能在殿试中找到解决之道，而倩莲则誓死守护在他身边。兰溪县的故事由此揭开序幕，一场恩仇交织的对决即将上演。
