《日本少林》是一部充满传奇色彩的电影。故事发生在一百多年前，中国少林武学家武天行远赴日本传授武学技艺，却无意间触怒了当地的四大御前侍卫家族——千叶、清水、佐藤和铃木。经过一番激烈的对决后，武天行相继击败了前三家，并最终与千叶家的门主千叶奔雷展开了一场惊心动魄的大战。尽管武天行胜出，但千叶奔雷心中始终不甘，立誓要再次向武天行挑战。一百年后，千叶家族的传人千叶归一继承了先祖遗志，四处寻找武家后裔，以图重振门庭。然而，归一性格刚烈，只知练武而不懂其他生计技能，不得不依靠乞讨为生。与此同时，在一个偏远的小渔村中，武天行的后代武道一则与从小一起长大的青梅竹马子慧在同一家豆腐店工作。武道一利用空闲时间在店里天井开设了一座小小的武馆，但多年来只有一名徒弟前来拜师。父亲临终前叮嘱武道一，切勿轻易动武，并将一个佛珠交给他，提醒他谨慎行事。两代人的恩怨情仇，在现代日本社会的背景下缓缓展开，武道一如何面对家族的宿命与个人的情感纠葛，成为影片的一大看点。这不仅是一部动作片，更是一段关于传承、复仇和救赎的心路历程。
