在2004年的科幻巨制《哥斯拉之终极战役》中，人类与怪兽的故事再次上演。数年前，地球防卫部用超级战舰“轰天号”和其勇敢的舰长道格拉斯·戈登上校，在南极成功封印了哥吉拉，但地球并非只有这一种威胁。随着各种怪兽对城市发起攻击，“地球防卫部”应运而生，专门对抗怪兽入侵。其中，拥有M染色体的“超人类”，如尾崎真一少尉等，更是防务部队中的精英。近期，人们发现了一具奇异生物遗骸——这可能是一个来自外太空、能够融合机械与生物特性的怪物。“小美人”的警告揭示了这正是当年被封印的“盖刚”。不久，各地怪兽相继出现，城市陷入混乱。然而，突然出现的神秘飞行器宣称自己是地球的朋友，并揭露了一个惊人的真相：这些怪兽其实是外星人入侵时释放的武器。面对这突如其来的危机，道格拉斯·戈登上校提出了一个大胆计划——解开哥吉拉的封印，以这只地球上最强大的生物对抗外星侵略者。然而，要想成功实现这一目标，不仅需要解决技术难题，还得与“超人类”们紧密合作，共同对抗未知的威胁。在一系列紧张刺激的战斗中，“轰天号”的英雄们将面临前所未有的挑战和牺牲……
